Die Krankenhausapotheke versorgt alle stationären und in den Ambulanzen versorgten Patienten der Uniklinik Köln sowie der Mediapark- Klinik, der CardioKlinik Kalk und der Klinik links vom Rhein mit Arzneimitteln und apothekenpflichtigen Medizinprodukten.
Die Versorgung umfasst neben der Beschaffung und Arzneimittellogistik auch die Herstellung von Arzneimitteln z.B. für die onkologische Therapie und die Versorgung von Kindern sowie die Beratung zur Lagerung, richtigen Anwendung und Wirtschaftlichkeit in der Arzneimitteltherapie.
Die Krankenhausapotheke unterstützt die Sicherstellung der Arzneimitteltherapiesicherheit in der gesamten Uniklinik. Dazu wird eine patientenindividuelle Arzneimittelversorgung im Sinne eines Closed Loop Medication Managements etabliert.
Aufgabe der Krankenhausapotheke ist darüber hinaus die Unterstützung von klinischen Studien im Hinblick auf die Studienmedikation.